过了一段时间,仇鸾的劣迹被曝光了,杨继盛的好日子就来了,先起复为诸城知县,又调任南京户部主事,再升任刑部员外郎。严嵩对仇鸾特别愤恨,杨继盛弹劾过仇鸾,让严阁老十分满意,想要重点提拔他。可是在杨继盛眼里,严嵩也不什么好东西,甚至比仇鸾还要恶劣,于是上疏弹劾严嵩,说他有十大罪状,主要内容和沈炼的差不多。他最后要求:“愿陛下听臣之言,察嵩之奸。或召问裕、景二王,或询诸阁臣。重则置宪,轻则勒致仕。内贼既去,外贼自除。虽俺答亦必畏陛下圣断,不战而丧胆矣。”对于杨继盛的指控,嘉靖皇帝并不采纳,把他关进监狱,就是不判刑,事情活活拖了三年,也没个结果。
朱厚熜没有杀死杨继盛的打算,这可急坏了严嵩党羽。胡植、鄢懋卿两位严党人士,就对主子说:“留着杨继盛,不除掉他,就是养虎遗患呀!”那怎么除?正好都御史张经、李天宠犯了大罪,皇帝大概是要判他们死刑的,于是杨继盛的名字就被附在死刑名单后面,朱厚熜在不注意的时候,签了同意,可以把杨继盛铲除了。消息传出来,杨夫人跪在皇宫门前,上疏朝廷,请求替丈夫死。可惜这份文件没有传到皇帝手里,而是落入了严嵩的手里,他就压着,不上报。嘉靖三十四年(公元1555年)十月,杨继盛在西市殒命,临刑时赋诗一首:“浩气还太虚,丹心照千古。生平未报恩,留作忠魂补。”天下争相传诵,以此表达对严嵩、对朝廷的不满。